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DNA测序
DNA测序模仿了在染色体复制过程中复制细胞DNA的基本过程,只是该过程是在试管或微量滴定板中使用最少的一组组分完成的。
大多数DNA测序技术都要求有一个“模板”(即要确定其序列的DNA的生物学样品)。
“引物”(即与模板区域互补并能够延伸的短寡核苷酸);
DNA聚合酶,按照模板链的指示,在引物上依次添加结构单元。
和四个构建基块本身。
该技术还必须体现一种方法,通过该方法可以检测添加到底漆中的结构单元的顺序。
使用选择的检测方法,
大多数大型DNA测序设备都使用荧光染料标记和检测四个碱基,并根据大小通过毛细管电泳分离DNA分子,从而可以识别序列中每个位置的碱基。
更具体地说,对于添加到测序反应中的每个结构单元的分子中的一小部分,该结构单元经过化学修饰并用可区分的染料标记,这样,当将修饰的结构单元随机添加到从引物,复制“终止”,结果测序反应包含大小不同的分子的混合物。
由于每个终止分子的末端均包含染料标记的碱基,因此可以确定与模板互补的链的序列。
上图显示了一组测序通道,其中电泳用于分离相差一个碱基的分子。
激光检测用于识别每个位置的碱基。
使用“ A”为绿色,“ C”为蓝色,“ G”为黄色,“ T”为红色的键从下至上“读取”序列。
使用测序仪制造商提供的软件,可以确定每个位置的染料信噪比,从而可以“调用”适当的碱基。
碱基顺序显示在“色谱图”或“迹线”文件中。
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