凝胶电泳染色：使用什么？

电泳是鉴定和分离大分子的常用实验室程序。它在19世纪初由莫斯科的一名大学科学家**观察到。像许多发现一样，这是偶然的，但已被证明对许多研究场景有用。通过施加电力，技术人员使用颗粒的负电荷或正电荷使其通过多孔基质（例如琼脂糖凝胶）迁移。当样品中存在带正电的分子时，它们会向负电流（阴极）蠕变，而带负电荷的分子则会迁移到正电流（阳极）。
 
除了电力和凝胶的来源之外，此动力学测试需要缓冲剂以帮助防止温度和pH极端值。所用凝胶的类型取决于样品和应用。凝胶是“固体”，但多孔。在凝胶中，较大的分子会移动得更慢，而较小的分子会快速移动。因此，分子大小是样品分离和分子鉴定的另一种方式。
所以，现在我们了解了电泳的动力学，我们如何看到这些粒子在哪里移动？分子可能是“宏观的”，但它们仍然太小而不能用肉眼观察。我们实验的**后一个必要成分是染色剂。一组染料可以让我们看到颗粒所走的路径。从那里，我们可以捕捉图像以记录结果。
DNA凝胶染色
存在几种用于在凝胶电泳期间染色核酸的选择。溴化乙锭（EtBr）是**常用的DNA染料。它是一种嵌入剂，与DNA结合，当暴露于紫外线时荧光增加20倍。EtBr是**便宜的DNA染色剂，使其成为许多研究实验室的理想选择。但是，EtBr必须小心使用，因为它是已知的诱变剂。此外，EtBr需要暴露于紫外线下才能看到，但会发生分子破坏。当DNA被用于诸如克隆之类的下游应用时，这就出现了一个问题。
替代DNA染料，如SYBR Safe，已经开发出来，它们不具有与EtBR相同的致突变性质。SYBR Safe不被认为是危险的，可以使用实验室的常规污水系统进行处理。此外，它在蓝光下发出荧光，防止使用紫外光时发生DNA损伤。
 
已显示许多DNA染色剂抑制聚合酶链式反应（PCR）。当需要高PCR效率时，如实时定量PCR，可行的DNA染色剂将是Eva Green。与其他常用电泳染料相比，它在较小程度上限制了PCR。伊娃格林也比传统的污渍如EtBr更安全。
 
蛋白质凝胶污渍
与DNA凝胶相似，染色蛋白凝胶有几种选择。两种**常见的污渍是考马斯亮蓝和银染。考马斯是一种阴离子染料，它非特异性地与蛋白质结合。一旦多余的污渍被去除，蛋白质条带就会显现为蓝色条带。由于易于使用且价格合理，考马斯染色法是蛋白质染色**常用的方法。
相反，银染比考马斯用于检测相对较低量的蛋白质更敏感。但是，灵敏度带来了一个代价，因为银染色也能与多糖和核酸结合，在银染凝胶上产生假带。