五种电泳技术的比较参数

五种电泳技术的比较 SDSPAGE 
  名词解释: 
  相对迁移率(Rf)    
  问答题: 
  1.简述SDS-PAGE的基本原理。   2.影响SDS电泳的关键因素有哪些?  AGE 
 名词解释 1.迁移率 2.电渗 3.电泳 
 问答题 
1.影响电泳迁移率的因素有哪些? 
2.试述琼脂糖凝胶电泳分离脂蛋白的原理。 CAME 
1.CAME的基本原理是什么? 
2.CAME分离血清蛋白电泳时应注意哪些问题? PAGE 名词解释 
1.凝胶总浓度 2.交联度 问答题 
1.与CAME相比,PAGE有哪些特点。 2.试比较CAME与PAGE操作的区别。 3.简述不连续PAGE的原理。 
 
1.琼脂糖凝胶电泳Agarose Gel Electrophoresis 
 Gel Electrophoresis :由琼脂、琼脂糖、淀粉胶及聚丙烯酰胺等物质作支持体的电泳。  特点(characteristic): 
1.可以制成非常均匀的凝胶,带电质点在凝胶的孔中泳动。  2. 电泳操作方法简便,电泳速度快。 
3. 分辨率高,重复性好,电泳图谱清晰。 4. 适用于生化,免疫等定性定量测定。 (一)优点(advantage) 
1.因不含硫酸根和羧基,几乎消除了琼脂的电渗。 
2.对蛋白质吸附极微,故无拖尾现象。 
3.凝胶结构均匀,孔径较大,可用来分离酶的复合物、核酸、病毒 等大分子物质。 4.透明度较好,可直接或干燥成薄膜后进行染色。 
5.不吸收紫外光,可直接利用紫外光吸收法作定量测定。 6.有热可逆性。 
(二)缺点(disadvantage) 
1.机械强度差,易破碎,浓度不能太低。2.易被细菌污染,不易保存,临用前配制。 
3.琼脂糖支持层上的区带易于扩散,电泳后必须立即固定染色。 4.与PAGE相比,分子筛(molecular sieve)作用小,区带少。  应用 
1. 适用于大分子的核酸、核蛋白等的分离、鉴定及纯化 2. 临床生化检验中常用于LDH、CK等同工酶的分离与检测 3. 为不同类型的高脂蛋白血症、冠心病等提供生化指标   影响迁移的因素 
 the size of the molecule 
 conformation of the molecule   the agarose concentration of a gel  Voltage 
百分浓度和分辨率限制 
 Most agarose gels are made with between 0.7% (good separation or resolution of large 
5–10kb DNA fragments) and 2% (good resolution for small 0.2–1kb fragments) agarose dissolved in electrophoresis buffer.  
 Up to 3% can be used for separating very tiny fragments but a vertical polyacrylamide 
gel 聚丙烯酰胺is more appropriate in this case.  
 Low percentage gels are very weak and may break when you try to lift them. High 
percentage gels are often brittle and do not set evenly. 1% gels are common for many applications.  
琼脂糖凝胶分离血浆脂蛋白 
原理:      血清脂蛋白经饱和苏丹黑B预染后,以琼脂糖凝胶为支持介质,在pH8.6巴比妥缓冲液中电泳,根据各脂蛋白的组成、大小、形状分离成不同区带。 
 pH 8.6 > pI ,各种脂蛋白均带负电,电泳时由负极到正极;VLDL为圆形,受阻力小,LDL形态不规则,受阻力大,所以VLDL跑在前。 加样槽在负极,由负极到正极分别是CMLDLVLDLHDL 
2.醋酸纤维薄膜电泳Cellulose acetate membrane electrophoresis,CAME 特点:低吸附作用,低电渗作用,样本用量少,亲水性 1.Low sorption 2.Low electroosmosis  3.Small sample 4.Hydrophilic  电泳图谱不齐 
①点样时血清点加不均匀 ②薄膜局部干燥 
③电泳时供给薄膜的液量不均匀或过少 ④缓冲液变质 
⑤电泳时薄膜位置不正,与电流方向不平行  电泳图谱分理不清 
①点样时血清点加不均匀 
②薄膜局部干燥 
③电泳时供给薄膜的液量不均匀或过少 ④缓冲液变质 ⑤电泳时薄膜位置不正,与电流方向不平行  电泳速度慢 
 电流过低 
 供给薄膜的液量不足  缓冲液离子强度过高 
 薄膜中杂质  
白蛋白区带中间部分不着色,染色不足 染色时间不够、点样过多 γ球蛋白向反方向移动 
电渗现象,可提高缓冲液液面或加大电流量以改进 区带一边长一边短呈扭曲现象 
薄膜未紧压在电泳槽的滤纸桥上,使薄膜接触不良而增大了电阻。  
区带拖尾或区带过于紧密 
缓冲液离子强度<0.05可出现区带拖尾;离子强度>0.075可出现区带过于紧密。 血清蛋白质醋酸纤维薄膜电泳Separate serum protein in cellulose acetate membrane electrophoresis 
[原理] CAME是以醋纤膜(CAM)作支持物的一种区带电泳技术。 
      将血清样品点样于醋纤膜上,在pH8.6的缓冲液中电泳时,血清蛋白质均带负电荷移向正极。由于血清中各蛋白组分等电点不同而致表面净电荷量不等,加之分子大小和形状各异,因而电泳迁移率不同,彼此得以分离。加样:用加样器蘸取血清约5ul,垂直印在CAM粗糙面,点样区距离边缘约1.5cm,电泳时点样面朝下。加上槽盖平衡5分钟后再通电。电压10~15V/cm膜总宽。电泳40~60分钟,泳动距离约达3.5~4cm时即可断电。 由负极到正极可分为五条条带 γ β α2 α1 白蛋白 #p#分页标题#e#
3.聚丙烯酰胺凝胶电泳Polyacrylamide Gel Electrophoresis PAGE 
        PAG是由丙烯酰胺(acrylamide,Acr)单体和N,N’-亚甲双丙烯酰胺(N,N,N’,N’-methylene bisacrylamide,Bis)交联剂通过自由基( free radicals)聚合而成的一种多孔三维网状结构。 
    过硫酸胺[(NH4)2S2O8](Ammonium persulfate,AP)作为催化剂,四甲基乙二胺(-N,N,N',N'-tetramethylethylene diamine , TEMED)为加速剂。  ¬TEMED量多少都会影响催化作用,须在碱性条件下聚合   -分子氧存在,聚合不完全,须去除分子氧,隔绝氧 
  ®升高温度能提高聚合,降低温度能延迟聚合 
PAG孔径的大小主要由Acr和Bis这两种单体的浓度决定。可以根据要分离物质分子的大小,选择合适的单体浓度。 
Acr/Bis:20~40   完全透明且有弹性;          <10    很脆,易碎,不透明;          >100   糊状不成形,易破碎 常用的标准凝胶是指浓度为7.5%的凝胶 交联度C——Bis占单体与交联剂总量的百分比。 C=b/(a+b)×100% 
电极槽缓冲液通常为pH8.3 Tris-甘氨酸缓冲液  分离原理 1. 浓缩效应 1)凝胶层的不连续性 
  两层凝胶T与C不同孔径不同 
  浓缩胶孔径大,分离胶孔径小,蛋白质在大孔径浓缩胶中移动,受阻力小,移动速度快。  2)缓冲液离子成分的不连续性 
甘氨酸(pI=6.0)在pH8.3带负电,朝正极移动,进入浓缩胶(pH6.7),甘氨酸解离度()很小,有效迁移率(M )很低,移动速度较慢,称为慢离子。 HCl 是强电解质,=1,Cl-有效迁移率大,移动速度快,称快离子。 蛋白质(pI<6.0)带负电荷,有效迁移率介于两者之间。  3)pH值的不连续性 
     为了控制慢离子的解离度,从而控制其有效迁移率,必须使浓缩胶与分离胶之间pH值有所区别。 
3.分子筛效应与电荷效应 
    进入分离胶后,Gly-
成为快离子 
    分离胶只有电荷效应和分子筛效应,根据各蛋白质所带电荷不同、分子大小不同而分离 
PAGE特点 
1.具有分子筛效应,分辨率高 
2.样品不易扩散,用量少,灵敏度可达10-6g 
3.化学性质稳定,分子结构中富含酰胺基具有稳定的亲水基团 4.凝胶不带电荷,消除了电渗现象 
5.机械强度好,有弹性,在一定浓度范围内无色透明 
6.网孔可调节  4.SDSPAGE 
十二烷基硫酸钠(sodium dodecyl sulfate,SDS,also called lauryl sulfate) 是一种阴离子去污剂(anionic detergent )。 
• 作用:破坏蛋白质分子之间以及其他物质分子之间的非共价键,使蛋白质变性
(denature)而改变原有的构象; • 保证蛋白质分子与SDS充分结合而形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物。 原理 
(一)蛋白质分子的解聚 
    样品介质和聚丙烯酰胺中加入离子去污剂和强还原剂后,蛋白质亚基的电泳迁移率主要取决于亚基分子量的大小(molecular mass of polypeptides ),而电荷因素可以被忽略。 1、SDS 
   阴离子去污剂(anionic detergent )    变性剂(denaturant)    助溶性试剂  
    断裂分子内和分子间的氢键(hydrogen bond)     分子去折叠 
    破坏蛋白质分子的二级和三级结构 2、强还原剂 
   巯基乙醇(β-mercaptoethanal)     
   二硫苏糖醇(dithiothreitol,DTT)使半胱氨酸残基之间的二硫键(disulfide bond)断裂。 
 SDS和还原剂的作用: 
(1)分子被解聚 
(2)氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负   
     电荷的蛋白质-SDS胶束。 
(3)蛋白质-SDS胶束所带的负电荷大大超         过了蛋白质分子原有的电荷量,消除      了不同分子之间原有的电荷差异。 
去污剂的选择 
无离子去污剂:Lubro W;Brij35, Tween                   Triton 
阳离子去污剂:cetyltrimethyl ammonium                bromide (CTAB)               cetylpyyridinium (CPC) 阴离子去污剂:SDS   deoxycholate 
电泳过程中的不正常现象 (1)“微笑”现象 
    指示剂前沿呈现两边向上的曲线形,说明凝胶的不均匀冷却,中间部分冷却不好。 2)“皱眉”现象 
    由于垂直电泳槽的装置不合适引起的,特别是当凝胶和玻璃板组成的“三明治”底部有气泡或靠近隔片的凝胶聚合不完全。 (3)“拖尾”现象 
     样品溶解不佳引起。 (4)“纹理”现象 
由于样品中的不溶颗粒引起的。 (5)偏斜现象 
    电极放置不平行引起或加样位置偏斜而引起 (6)带太宽 #p#分页标题#e#
     加样量太多或加样孔泄漏引起 分子量测定 
1、相对迁移率(relative mobility ,Rf) 
  Rf即用每个带的迁移距离除以溴酚蓝前沿的迁移距离得到的。   测量位置应在蛋白带的中央。
2、作图 
   以已知蛋白质分子量的常用对数值为纵坐标,Rf为横坐标绘图 3、通过测定未知蛋白质的Rf值,便可在标 准曲线上读出他的分子量 
5.等电聚焦电泳Isoelectric Focusing Electrophoresis, IEFE  
等电聚焦电泳(IEFE)是一种利用具有pH梯度的支持介质分离等点电(PI)不同的蛋白质的电泳技术。 
原理:    在电泳介质中加入载体两性电解质,通电后,两性电解质会逐渐形成一个由正极到负极递增的pH梯度,在此体系中,不同的蛋白质移动并聚焦于与其等电点相当的pH位置。 
理想的载体两性电解质应具备的特征 ①化学性质稳定; ②分子量要小 
→以便与被分离大分子物质分离; 
③各成分的pI彼此接近,并在其pI值附近有良好的缓冲能力 →梯度稳定; 
④两性电解质载体的数目要足够多 
→梯度平滑 ; 
⑤对280nm的紫外光没有或仅有很低的吸光度 →不影响测定。 优点:  
 分辨率高(可达0.01pH单位); 
 灵敏度高(**低检出量达0.1ng);  电泳区带狭窄; 
 重复性好。 缺点:  
 要求用无盐溶液,而在无盐溶液中蛋白质可能发生沉淀;   由于样品中的成分会停留在其pI,不适用在pI不溶的蛋白质。 IEFE应用  
 1.分析分离制备蛋白质、多肽  
 ①区分人血清蛋白  
 ②测出异常免疫球蛋白   ③基因分型  
 ④csf中寡克隆区带的检测   2.测定pI可鉴定蛋白质、多肽   3.双相电泳中,IEFE作为**相